Fraunhofer-Institut für Toxikologie und Experimentelle MedizinDie Amplifikation von DNA oder RNA aus minimalen Probenmengen führt zu erheblichem Rauschen in den NGS-Daten. Dieses Rauschen entsteht vor allem durch Abweichungen in der Amplifikationseffizienz in unterschiedlichen Bereichen des Genoms/Transkriptoms oder durch Polymerase-bedingte Sequenzfehler. Diese spezifischen Eigenarten von amplifizierten Daten müssen bei nachgeschalteten bioinformatischen Analysen eingehend berücksichtigt werden. Am Fraunhofer ITEM verwenden wir entweder sorgfältig ausgewählte Open-Source-Software, die wir nach Bedarf anpassen und in unseren Analyseablauf integrieren, oder wir entwickeln eigene innovative Applikationen zur Bearbeitung spezieller Fragestellungen.