Mehrstufige Qualitätskontroll-Assays ermöglichen die Auswahl optimaler NGS-Proben

Die Übertragung der Ergebnisse von Einzelzellgenom- und -transkriptomanalysen in klinische Anwendungen erfordert darauf optimal zugeschnittene Qualitätskontrollen. Unter Berücksichtigung der Anforderungen an eine Routinediagnostik haben wir einen dreigleisig arbeitenden Qualitätskontroll-Assay entwickelt, mit dem sich die Qualität jeder mit dem Ampli1-WGA-Verfahren amplifizierten Probe vor der Weiterleitung an eine nachgeschaltete NGS-Anwendung überprüfen lässt. Die Qualitätskontrolle erlaubt nicht nur eine Vorhersage, welche Genombereiche nach der Sequenzierung des gesamten Genoms mit großer Wahrscheinlichkeit entdeckt werden, sondern auch eine Bestimmung der Exonbereiche, auf die durch Sequenzierung des gesamten Exoms zugegriffen werden kann. Als Ergänzung zu dem Ampli1-WGA-Qualitätskontroll-Assay haben wir nach dem gleichen Prinzip einen dreigleisigen Qualitätskontroll-Assay für die Amplifikation des Transkriptoms von Einzelzellen (Ampli1 WTA) entwickelt.

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