Fraunhofer-Institut für Toxikologie und Experimentelle Medizin
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Targeted Metabolomics

LC-MS/MS- basierte targeted metabolomics

Analytische Chemie am Fraunhofer ITEM Metabolomik
© Fraunhofer ITEM, Ralf Mohr
Das Metabolom umfasst die Gesamtheit aller kleinen Moleküle, die in den verschiedenen Kompartimenten eines Organismus vorkommen.

Wir bieten standardisierte und quantitative Metabolomanalysen mit hohem Probendurchsatz mittels LC-MS/MS und NMR-Spektroskopie an. 

Wir sind ein von Biocrates® zertifiziertes Labor und bieten standardisierte Labor- und Kit-basierte Arbeitsabläufe. Der Kit-basierte Ansatz bietet folgende Vorteile:

  • Hohe Analytenabdeckung durch gezielte Bestimmung von 1019 Metaboliten aus 39 biochemischen Substanzklassen pro Probe
  • Hoher Probendurchsatz, der die Analyse von mehr als 600 Proben innerhalb von 2 Wochen ermöglicht
  • Anwendbarkeit auf verschiedene Matrices wie Plasma, Serum, Urin, Stuhl und Gewebeproben von verschiedene Spezies wie Ratte, Maus, Mensch usw. 
  • Standardisierte Datenverarbeitung, wobei die Daten in einem editierbaren Excel-Format geliefert werden, was den Transfer für die Datenauswertung erleichtert

NMR-basierte targeted metabolomics

Wir bieten standardisierte NMR-basierte Metabolomanalysen unter Verwendung von Bruker IVDr-Analysepaketen (B.I.)

 

  • Vollständig quantitative Bestimmung von mehreren hundert Metaboliten aus diversen biochemischen Substanzklassen unter Verwendung von:
    • B.I.Quant-PS - Quantifizierungspaket für Humanplasma & -serum
    • B.I.LISA - Liboprotein-Subklassen-Analyse für Humanplasma & -serum 
    • B.I.Quant-UR ex - Erweiterte Quantifizierungsmethode für Humanurin
  • Anwendbarkeit auf verschiedene Körperflüssigkeiten wie Plasma, Serum, Urin, CSF und Methanolextrakte von Geweben usw. 
  • Zerstörungsfreie Probenanalyse mit hoher Reproduzierparkeit 

 

Targeted Metabolomics Ablauf
© Fraunhofer ITEM, Ralf Mohr
Die Zahl der Metaboliten in jedem Organismus ist riesig, und ihre Gesamtheit kann nicht mit einer einzigen Analysemethode erfasst werden.

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Sven Schuchardt

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Dr. Sven Schuchardt

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Publikationen

  • Shahrokny, P., Maison, N., Riemann; L., Ehrmann, M., DeLuca, D., Schuchardt, S.,Thiele, D., Weckmann, M., Dittrich, A. M., Schaub, B., Brinkmann, F., Hansen, G., Kopp, M. V., von Mutius, E., Rabe, K. F., Bahmer, T., Hohlfeld, J. M., Grychtol, R., Holz, O. and The ALLIANCE Study Group (2024): Increased breath naphthalene in children with asthma and wheeze of the All Age Asthma Cohort (ALLIANCE). Journal of Breath Research, 18:016003. https://iopscience.iop.org/article/10.1088/1752-7163/acf23e
  • Ringseis, R., Marschall, M.J.M., Grundmann, S.M., Schuchardt, S., Most, E., Gessner, D.K., Wen, G., Eder, K. (2023): Effect of Hermetia illucens Fat, Compared with That of Soybean Oil and Palm Oil, on Hepatic Lipid Metabolism and Plasma Metabolome in Healthy Rats. Animals, 13:3356. https://www.mdpi.com/2076-2615/13/21/3356
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