Fraunhofer-Institut für Toxikologie und Experimentelle Medizin
Fraunhofer-Institut für Toxikologie und Experimentelle Medizin

Targeted Metabolomics

LC-MS/MS- basierte Targeted Metabolomics

Analytische Chemie am Fraunhofer ITEM Metabolomik
© Fraunhofer ITEM, Ralf Mohr
Das Metabolom umfasst die Gesamtheit aller kleinen Moleküle, die in den verschiedenen Kompartimenten eines Organismus vorkommen.

Wir bieten standardisierte und quantitative Metabolomanalysen mit hohem Probendurchsatz mittels LC-MS/MS 

Wir sind ein von Biocrates® zertifiziertes Labor und bieten standardisierte Labor- und Kit-basierte Arbeitsabläufe. Der Kit-basierte Ansatz bietet folgende Vorteile:

  • Hohe Analytenabdeckung durch gezielte Bestimmung von mehr als 1000 Metaboliten aus zahlreichen biochemischen Substanzklassen pro Probe
  • Hoher Probendurchsatz, der die Analyse von mehr als 600 Proben innerhalb von 2 Wochen ermöglicht
  • Anwendbarkeit auf verschiedene Matrices wie Plasma, Serum, Urin, Stuhl und Gewebeproben von verschiedene Spezies wie Ratte, Maus, Mensch usw. 
  • Standardisierte Datenverarbeitung, wobei die Daten in einem editierbaren Excel-Format geliefert werden, was den Transfer für die Datenauswertung erleichtert

NMR-basierte Targeted Metabolomics

Wir bieten standardisierte NMR-basierte Metabolomanalysen unter Verwendung von Bruker IVDr-Analysepaketen (B.I.)

 

  • Vollständig quantitative Bestimmung von mehreren hundert Metaboliten aus diversen biochemischen Substanzklassen unter Verwendung von:
    • B.I.Quant-PS - Quantifizierungspaket für Humanplasma & -serum
    • B.I.LISA - Liboprotein-Subklassen-Analyse für Humanplasma & -serum 
    • B.I.Quant-UR ex - Erweiterte Quantifizierungsmethode für Humanurin
  • Anwendbarkeit auf verschiedene Körperflüssigkeiten wie Plasma, Serum, Urin, CSF und Methanolextrakte von Geweben usw. 
  • Zerstörungsfreie Probenanalyse mit hoher Reproduzierparkeit 

 

Targeted Metabolomics Ablauf
© Fraunhofer ITEM, Ralf Mohr
Die Zahl der Metaboliten in jedem Organismus ist riesig und ihre Gesamtheit kann nicht mit einer einzigen Analysemethode erfasst werden.

Metabolomik-Forschung am Fraunhofer ITEM - Kontaktieren Sie uns!

Schreiben Sie eine Nachricht an das Projektteam

* Pflichtfelder

Ihr Ansprechpartner für Bio- und Umweltanalytik

Sven Schuchardt

Contact Press / Media

Dr. Sven Schuchardt

Abteilungsleiter Bio- und Umweltanalytik

Telefon +49 511 5350-218

Publikationen

  • Shahrokny, P., Maison, N., Riemann; L., Ehrmann, M., DeLuca, D., Schuchardt, S.,Thiele, D., Weckmann, M., Dittrich, A. M., Schaub, B., Brinkmann, F., Hansen, G., Kopp, M. V., von Mutius, E., Rabe, K. F., Bahmer, T., Hohlfeld, J. M., Grychtol, R., Holz, O. and The ALLIANCE Study Group (2024): Increased breath naphthalene in children with asthma and wheeze of the All Age Asthma Cohort (ALLIANCE). Journal of Breath Research, 18:016003. https://iopscience.iop.org/article/10.1088/1752-7163/acf23e
  • Ringseis, R., Marschall, M.J.M., Grundmann, S.M., Schuchardt, S., Most, E., Gessner, D.K., Wen, G., Eder, K. (2023): Effect of Hermetia illucens Fat, Compared with That of Soybean Oil and Palm Oil, on Hepatic Lipid Metabolism and Plasma Metabolome in Healthy Rats. Animals, 13:3356. https://www.mdpi.com/2076-2615/13/21/3356
  • Dutsch, A., Uhlig, C., Bock, M., Graesser, C., Schuchardt, S., Uhlig, S., Schunkert, H., Joner, M., Holdenrieder, S., & Lechner, K. (2023): Multi-Omic Candidate Screening for Markers of Severe Clinical Courses of COVID-19. Journal of Clinical Medicine, 12:6225. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10573369/
  • Starke, S., Harris, D.M.M., Zimmermann, J., Schuchardt, S., Oumari, M., Frank, D., Bang, C., Rosenstiel, P., Schreiber, S., Frey, N., Franke, A., Aden, K., Waschina, S. (2023):  Amino acid auxotrophies in human gut bacteria are linked to higher microbiome diversity and long-term stability. The ISME Journal. https://www.nature.com/articles/s41396-023-01537-3
  • Seeliger, B., Carleo, A.., Wendel-Garcia,  P.D., Fuge, J., Montes-Warboys, A., Schuchardt, S., Molina-Molina, M.,  Prasse, A. (2022): Changes in serum metabolomics in idiopathic pulmonary fibrosis and effect of approved antifibrotic medication. Frontiers in Pharmacology. 13.  https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fphar.2022.837680/full  
  • Diboun, I., Cyprian, F.S., Anwardeen, N.R., Yassine, H.M., Elrayess, M.A., Rahmoon, S.M., Sayed, S.K., Schuchardt, S., Khatib, M., Bansal, D., Farag, E.A.B.A., Emara, M.M., Abdallah, A.M. (2022): Identification of prognostic metabolomic biomarkers at the interface of mortality and morbidity in pre-existing TB cases infected with SARS-CoV-2. Frontier in Cellular and Infection Microbiology. 12:929689. https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcimb.2022.929689/full
  • Elrayess, M.A., Cyprian, F.S., Abdallah, A.M., Emara, M.M., Diboun, I., Anwardeen, N., Schuchardt, S., Yassine, H.M.(2022): Metabolic signatures of type 2 diabetes mellitus and hypertension in COVID-19 patients with different disease severity. In: Front Med (Lausanne).8:788687. https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmed.2021.788687/full
  • Holz, O., van Vorstenbosch, R., Guenther, F., Schuchardt, S., Trinkmann, F., von Schooten, F.J., Smolinska, A., Hohlfeld, J.M. (2022): Changes of breath volatile organic compounds in healthy volunteers following segmental and inhalation endotoxin challenge. In: Journal of Breath Research. 16 (3), 037102. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35366648/
  • Chen, F., Elgaher, W.A.M., Winterhoff, M., Büssow, K., Waqas, F. H., Graner, E. Pires-Afonso, Y., Casares Perez, L., de la Vega, L., Sahini, N., Czichon, L., Zobl, W., Zillinger, T., Shehata, M., Pleschka, S., Bähre, H., Falk, C., Michelucci, A., Schuchardt, S., Blankenfeldt, W., Hirsch, A. K. H., Pessler, F. (2022): Citraconate inhibits ACOD1 (IRG1) catalysis, reduces interferon responses and oxidative stress, and modulates inflammation and cell metabolism. In: Nature Metabolism. 4:534. https://www.nature.com/articles/s42255-022-00577-x
  • Taleb, S., Yassine, H.M., Benslimane, F.M., Smatti, M.K., Schuchardt, S., Albagha, O., Al-Thani, A.A., Ait Hssain, A., Diboun, I., Elrayess, M.A. (2021): Predictive biomarkers of intensive care unit and mechanical ventilation duration in critically-Ill coronavirus disease 2019 Patients. In: Front Med (Lausanne).8:733657. https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmed.2021.733657/full
  • Luo, Y., Möhn, N., Al-Mekhlafi, A., Schuchardt, S., Skripuletz, T., Sühs, W., et al. (2020): Targeted metabolomic profiling of cerebrospinal fluid from patients with progressive multifocal leukoencephalopathy. In: PLoS ONE. 15(11): e0242321. https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0242321