Fraunhofer-Institut für Toxikologie und Experimentelle MedizinAuch wenn es in den letzten Jahren erhebliche Fortschritte gegeben hat, kämpfen die NGS-Technologien für Einzelzellen noch immer mit zwei grundlegenden technischen Herausforderungen: (1) homogene und repräsentative Amplifikation von DNA und/oder mRNA in ausreichenden Mengen für nachgeschaltete Anwendungen und (2) zuverlässige Identifizierung von Fehlern, die sich durch die Amplifikation in von Einzelzellen abgeleitete Nukleinsäuren eingeschlichen haben. Die Wissenschaftler am Fraunhofer ITEM in Regensburg haben sich beiden Anforderungen gestellt und Verfahren entwickelt, mit denen sich ausreichende Mengen von amplifiziertem Material in hoher Qualität generieren lassen, um wiederholte Tests mit den amplifizierten Proben durchführen sowie Proben in Biobanken einlagern zu können. Darüber hinaus haben sie beim WGA-Verfahren Barcode-Strategien implementiert, mit denen Sequenzfehler, die bei der WGA oder der Sequenzierung entstehen, identifiziert werden können.